An drei Standorten können die Sportler entscheiden welche Distanz sie bewältigen wollen. Für alle drei Strecken ist das Ziel Garmisch-Partenkirchen. Die kurze Runde des SCOTT Zugspitz Marathon führt von Lermoos auf rund 59 Kilometern nach Garmisch-Partenkirchen. Hier gilt es 1215 Höhenmeter zu bezwingen. Die mittlere Runde mit Start in Grainau wartet mit knapp 78 Kilometern und knapp 2100 Höhenmetern auf. Die Königsetappe ab Garmisch-Partenkirchen stellt die ultimative Herausforderung an die Marathonis dar. Nach 110 Kilometern rund um Deutschlands höchsten Berg werden die Sportler mit 2.984 Höhemetern einmal die Zugspitze in den Beinen haben.